第三十五章生物信息思考上(3/3)

贝叶斯公式的运算，个体的重要性对个体来说是无限大的，如同心学的无我无世界；于是就有这样的耦合关系：整体网络的坍缩构建个体，个体的无限扩散形成网络。其都是竞争的结果：个体之间，个体和整体之间，整体和整体之间。这个耦合的结构拥有波函数的性质，它总是在正常运行，我们进行观察是只能观察其整体过程的一部分（物理界人称坍缩），即选择性表达。其对环境的适应度很高

相似性，同源性，由于序列的相似性—结构的相似性—功能的相似性

空位罚分是一种匹配的手段，是局部最优的

打分矩阵，替代矩阵

seeds，种子，模式的本征

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